公開見積【役務】ゲノム解析(ロングリード)【バイオ】 - 2025年11月26日登録（案件ID:32433956）

g-keiyaku@nite.go.jp(@は半角に修正して送信すること) 役務の内容 2.1. 解析対象サンプル 微生物株試料 合計 11 サンプル 細菌(全て BSL1)、（細胞数 5×10^9 もしくは湿重量 100 mg 程度） Tepidimicrobium xylanilyticum（2 株） Megasphaera massiliensis Eubacterium limosum "Microscilla sericea" Marivirga tractuosa (2 株) Pseudoclavibacter triregoionum (2 株) Nocardioides panacisoli Citricoccus zhacaiensis 2.2. 解析対象サンプルの送付 解析対象サンプルを受注者へ送付する際の費用は NITE が負担する。送付方法について は NITE 担当者（以下「担当者」という。）と協議の上決定すること。 2.3. ゲノム DNA の調製 2.1 記載の解析対象サンプルについて DNA 抽出を行い、ゲノム解析用のゲノム DNA を 調製すること。 なお、調製したゲノム DNA は、DNA 濃度測定を行い、量と品質が 2.4 におけるゲノム 情報決定に十分なもの（GQN が 5 以上、平均長 15 kb 以上、低分子が見られないこと） であることを確認し、ゲノム情報決定の作業に入る前に担当者にメールで承認を得るこ と。また、量、品質が満たなかった場合の進め方については、担当者と協議の上、決定す ること。 2.4. ゲノム情報決定 (1) 2.3 において調製したゲノム DNA を用いてライブラリ調製を行い、ゲノムシーケンス 解析を行うこと。 (2) シーケンス解析は、PCR 増幅してライブラリを作製し、PacBio Revio または Sequel lle を用いて HiFi リードを取得すること。 (3) 1 サンプルあたりの取得データ量の目安は、200 Mb 程度とすること。 (4) 得られたシーケンスデータはアセンブルを行うこと。